Границы местообитаний пелагических сообществ и популяций раньше считали совпадающими с границами водных масс. Позже описания структуры местообитаний становились все более детальными. При этом изучаемые типы сообществ становились все более узкими таксономически. В результате биотопическая структура пелагиали сейчас представляется более сложной, чем ранее. Это хорошо видно на примере пелагиали Черного моря, особенно в период сильной летней стратификации.