Изменчивость нуклеотидных последовательностей маркеров двух генов (Co-1 и H3) Litorogammarus karadagiensis (Grintsov, 2009) (Amphipoda, Gammaridae) и систематика рода Litorogammarus
Loading...
Files
Date
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Исследована внутри- и межвидовая изменчивость гена субъединицы I цитохромоксидазы c митохондриальной ДНК (Co-1) и гена гистона H3 ядерной ДНК представителей рода Litorogammarus. Показано, что молекулярный маркер гена гистона H3 не подходит для видовой идентификации Litorogammarus ввиду своей недостаточной изменчивости. Таксономия изученных видов рода уточнена на основании анализа молекулярного маркера гена Co-1. Результаты комплексного анализа генетических расстояний (p-расстояний), выполненного с помощью ABGD и ASAP, подтверждают значимость участка гена Co-1 как маркера для идентификации видов рода Litorogammarus. На основе информации для четырёх филогенетических реконструкций и анализа топологии соответствующих генных деревьев для Co-1 выяснена генетическая близость видов L. karadagiensis и L. glareophilus. Для этих двух видов выявлены общие морфологические признаки — перистые щетинки на мандибулах, максиллах первой пары, максиллипедах и члениках гнатопод первой и второй пар. Использование молекулярных и морфологических данных в интегративном подходе представляется перспективным для идентификации видов и для решения таксономических вопросов в пределах анализируемой группы амфипод.
Description
We investigated intra- and interspecific variability of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I gene (COI) and nuclear DNA histone H3 gene in Litorogammarus representatives. Our results indicate that histone H3 molecular marker is not suitable for species identification in this genus due to its insufficient sequence variability. The taxonomy of the studied species was refined based on the analysis of COI gene marker. Comprehensive analysis of genetic distances (p-distances) performed involving ABGD and ASAP algorithms suggested that COI gene fragment is a diagnostic marker for species identification in Litorogammarus. Phylogenetic reconstruction based on four methods and analysis of the resulting gene trees for COI revealed close genetic relationship between L. karadagiensis and L. glareophilus. For these two species, we found several common morphological features: the presence of plumose setae on the mandibles, first maxillae, maxillipeds, and on the articles of the first and second gnathopods. The combined use of molecular and morphological data proved to be highly valuable for species identification and for resolving taxonomic issues within this group of amphipods.
Citation
Золотова А. О., Гринцов В. А., Рябушко В. И., Картавцев Ю. Ф. Изменчивость нуклеотидных последовательностей маркеров двух генов (Co-1 и H3) Litorogammarus karadagiensis (Grintsov, 2009) (Amphipoda, Gammaridae) и систематика рода Litorogammarus // Морской биологический журнал. 2025. Т. 10, № 4. С. 51-59.