МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ В ИЗУЧЕНИИ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИЙ ЧЕРНОМОРСКОЙ КУМЖИ
Molecular genetic methods applied to study the population structure of the Black Sea trout
Molecular genetic methods applied to study the population structure of the Black Sea trout
Дата
2016
Авторы (alternative)
Название журнала
Номер ISSN
Название тома
Издатель
Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика
Аннотация
Широкое использование молекулярных маркеров для оценки генетического разнообразия позволило получить ценный материал для филогении и эволюции кумжи. В настоящей работе проведен анализ полиморфизма Д-петли митохондриальной ДНК и 9 микросателлитных локусов для характеристики популяционно-генетической структуры Salmo trutta Понто-каспийского бассейна, а также для уточнения филогеографического положения исследованных групп кумжи. Полученные данные (11 митохондриальных гаплотипов и 138 STR-аллелей) позволили продемонстрировать существенную генетическую дифференциацию природных популяций, которые в целом объединялись в клады по бассейновому принципу. Однако и характер распространения мажорного митохондриального гаплотипа BS5, и динамика частот микросателлитных аллелей свидетельствовали об антропогенном влиянии, нарушающем генетическую целостность локальных популяций вследствие зарыбления их естественных мест обитания из РМС. В итоге, черноморские популяции идентифицированы как Дунайская филогенетическая линия, а большинство исследованных популяций характеризовалось уникальным генофондом, что актуализирует меры по защите подвидового разнообразия черноморской кумжи.
Аннотация (alternative)
The extensive use of molecular primers to assess genetic diversity has allowed us to obtain some valuable material for the phylogenetic and evolutional studies of Salmo trutta. We have analyzed polymorphism of mtDNA D-loop and ten microsatellite loci in order to characterize the population-genetic structure of S. trutta from the Ponto-Caspian basin, as well as to clarify the phylogeographic situation with the fish investigated. The data obtained (11 mitochondrial haplotypes and 138 STR-alleles) show a significant genetic differentiation of natural populations, which are generally united in the clades on the basin principle. However, both the distribution pattern of main mitochondrial BS5haplotype and the frequency dynamics of microsatellite alleles give evidence of human impact that violates the genetic integrity of local populations due to the restocking of their natural habitat by fish from artificially-reared broodstocks. As a result, the Black Sea population has been identified as the Danube phylogenetic line, and the majority of the populations studied were characterized by a unique gene pool that makes measures to protect the species diversity of the Black Sea trout be urgent.
Ключевые слова
Salmo trutta, митохондриальная ДНК, микросателлитный анализ
Библиографическое описание
Морские биологические исследования: достижения и перспективы: в 3-х т. : сборник материалов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, приуроченной к 145-летию Севастопольской биологической станции (Севастополь, 19–24 сентября 2016 г.) / под общ. ред. А.В. Гаевской. – Севастополь : ЭКОСИ-Гидрофизика, 2016. – Т. 1. – 493с. https://repository.marine-research.ru/handle/299011/3080