АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО И ТАКСОНОМИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ БАКТЕРИОПЛАНКТОНА ЧЁРНОГО МОРЯ МЕТОДОМ NGS
GENETIC AND TAXONOMIC ANALYSIS OF THE BLACK SEA BACTERIOPLANKTON DIVERSITY USING NGS
GENETIC AND TAXONOMIC ANALYSIS OF THE BLACK SEA BACTERIOPLANKTON DIVERSITY USING NGS
Дата
2016
Название журнала
Номер ISSN
Название тома
Издатель
Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика
Аннотация
Методом массового параллельного секвенирования фрагмента гена 16S рРНК (NGS – next-generation sequencing) исследован бактериопланктон (включая фильтрующиеся формы) Севастопольской бухты (Чёрное море), р. Чёрная (юго-западный Крым) и гиперсоленого озера на мысе Херсонес (юго-западный Крым). Выявлены значительные различия в генетическом и таксономическом составе микробных сообществ из разных биомов и размерных фракций (пико >0.2 мкм и фемто <0.2 мкм).
Аннотация (alternative)
The next-generation sequencing (NGS) approach has been applied to sequence 16S rRNA gene fragments in a massively parallel way in bacterioplankton samples from Sevastopol Bay (the Black Sea), the Black river estuary (SW Crimea) and a hypersaline lake at Khersones cape (SW Crimea). Significant differences have been revealed in genetic and taxonomic diversity of the microbial communities from different biomes and size fractions (pico >0.2 µm versus femto <0.2 µm).
Ключевые слова
бактериопланктон, Чёрное море, 16S рРНК, филотипы, метагеномный анализ
Библиографическое описание
Морские биологические исследования: достижения и перспективы: в 3-х т. : сборник материалов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, приуроченной к 145-летию Севастопольской биологической станции (Севастополь, 19–24 сентября 2016 г.) / под общ. ред. А.В. Гаевской. – Севастополь : ЭКОСИ-Гидрофизика, 2016. – Т. 2. – 501 с. https://repository.marine-research.ru/handle/299011/3175