Поиск по автору "Mukhanov, V. S."
Сейчас показывается 1 - 19 из 19
Результаты на странице
Настройки сортировки
Материал Flow Cytometry–Measured Cryptophyta Abundance and Biomass in the Bransfield Strait During Austral Summer(Севастополь : ФИЦ ИнБЮМ, 2021) Mukhanov, V. S.; Sakhon, E. G.; Polukhin, A. A.; Artemiev, V. A.Материал Microcalorimetry of the smallest plankton fraction: in search for the sources of heat dissipation(2005) Mukhanov, V. S.; Kemp, R. B.Heat production by the plankton pico (0.2 to 2 μm) and femto (<0.2 μm) fractions was measured in the dark using a microcalorimetric method. It was surprisingly found that the femtofraction (FF) produced more heat per seawater volume (48 ± 24 (95% Cl) μW l-1) than the picofraction (25 ± 14 μW l-1). Consequently, we tested two hypotheses which could explain the phenomenon through a differentiation between the potential sources of heat in FF: (i) metabolism of ultramicrobacteria, the only living component in the fraction besides the non-metabolizing virioplankton which are unable to produce heat; (ii) extracellular chemical processes in aquatic environments. Results of micro-calorimetry and respirometry combined with the use of antimicrobial agents (ciprofloxacin, glutaraldehide, sodium azide), and microscopical examination (counts and sizing of bacteria in the measuring ampoules) showed that both sources contributed to the overall heat flow by FF but the non-living component was responsible for the bulk of it. Hydrolysis of high molecular weight organic substances dissolved in seawater, associated with bacterial extracellular enzyme activity, is considered the most probable source of the heat. If so, microcalorimetry has great prospective in aquatic microbial ecology and biochemistry as a powerful unspecific analytical method.Материал АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО И ТАКСОНОМИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ БАКТЕРИОПЛАНКТОНА ЧЁРНОГО МОРЯ МЕТОДОМ NGS(Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2016) Белых, О. И.; Муханов, В. С.; Краснопеев, А. Ю.; Рылькова, О. А.; Бутина, Т. В.; Тихонова, И. В.; Сахонь, Е. Г.; Потапов, С. А.Методом массового параллельного секвенирования фрагмента гена 16S рРНК (NGS – next-generation sequencing) исследован бактериопланктон (включая фильтрующиеся формы) Севастопольской бухты (Чёрное море), р. Чёрная (юго-западный Крым) и гиперсоленого озера на мысе Херсонес (юго-западный Крым). Выявлены значительные различия в генетическом и таксономическом составе микробных сообществ из разных биомов и размерных фракций (пико >0.2 мкм и фемто <0.2 мкм).Материал Влияние микроводорослей и их фильтратов на численность бактерий в среде выращивания камбалы калкана(2011) Рауэн, Т. В.; Ханайченко, А. Н.; Муханов, В. С.С помощью проточной цитометрии количественно исследовали влияние микроводорослей Chlorella vulgaris, Platymonas viridis, Dunaliella salina, Isochrysis galbana, Thalassiosira weissflogii и их фильтратов на рост бактерий в средах инкубации икры и выращивания личинок камбалы калкана Psetta maxima maeoticus на стадиях эндо- и экзогенного питания. Бактерицидный эффект I. galbana, о котором сообщается в ряде публикаций, обнаружен не был. Наиболее выраженным антибактериальным эффектом обладала хлорелла. Бактерицидное действие фильтрата культуры хлореллы по своей эффективности было сравнимо с действием её нефильтрованной культуры. С целью снижения численности бактерий в среде выращивания камбалы калкан добавление хлореллы целесообразно на всех стадиях развития калкана, включая стадию эндогенного питания. Присутствие хлореллы в среде выращивания может предупредить вспышку численности бактерий в момент перехода личинок на стадию экзогенного питания. Возможности и пути контроля бактериального роста на этапе смены типа питания у личинок калкана требуют дополнительных, более детальных исследований.Материал Влияние микроводоросли Chlorella vulgaris на динамику выклева Artemia salina и численность бактерий в среде выращивания артемии(2013) Рауэн, Т. В.; Муханов, В. С.; Ханайченко, А. Н.С целью оптимизации выращивания Artemia salina и снижения бактериальной нагрузки на среду выращивания личинок при её использовании в качестве живого корма исследовано влияние культуры микроводорослей Сhlorella vulgaris на скорость выклева науплиев артемий, динамику численности бактерий в среде их выращивания и интенсивность колонизации покровов науплиев бактериями. При добавлении С. vulgaris в среду инкубации артемий численность бактерий в ней была значительно ниже, чем в контроле (соответственно, 33.6 ± 0.12 ´106 и 82.7 ± 14 ´106 кл. мл-1 спустя 25 ч, t-тест, p<0,05), что указывает на хорошо выраженный антибиотический эффект хлореллы. В дальнейшем этот эффект сохранялся даже в условиях поступления в среду инкубации артемий большого количества органических веществ – дополнительного субстрата для бактерий, обусловленного метаморфозом науплиев, т.е. микроводоросли были способны сдерживать бактериальный рост. Присутствие C. vulgaris в среде инкубации артемий сокращало время выклева науплиев из цист и обеспечивало более синхронный метаморфоз, а степень колонизации покровов науплиев бактериями была достоверно ниже, чем в контроле.Материал ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ Т4-БАКТЕРИОФАГОВ СЕМЕЙСТВА MYOVIRIDAE В ПРИБРЕЖНЫХ ВОДАХ ЧЁРНОГО МОРЯ(Marine Biological Journal, 2016) Бутина, Т. В.; Муханов, В. С.; Букин, Ю. С.; Потапов, С. А.; Белых, О. И.; Рылькова, О. А.; Сахонь, Е. Г.Материал Динамика доли живых Copepoda в планктоне Севастопольской бухты и открытого прибрежья в 2010 – 2011 гг.(2011) Литвинюк, Д. А.; Алтухов, Д. А.; Муханов, В. С.; Попова, Е. В.Проведён анализ сезонной динамики общей численности мезозоопланктона, вклада в неё копепод и вида-вселенца Oithona brevicornis, а также доли живых организмов (ДЖО) на двух реперных точках в центральной части и на траверзе Севастопольской бухты. Для количественной оценки живой/мёртвой компоненты сообщества копепод и O. brevicornis использовали метод окраски зоопланктонных проб витальными красителями – нейтральным красным (НК) и диацетатом флуоресцеина (ДФ). Это первый опыт применения ДФ в исследованиях морского зоопланктона. Независимо от сезона и района исследования отмечена высокая вариабельность ДЖО (15 – 98 %). В открытых водах выявлена тенденция к снижению доли живых копепод и их вклада в общую численность мезоопланктона в весенний период. Статистически достоверная корреляция между этими переменными может быть обусловлена ужесточением конкурентных отношений в сообществе. В подверженных интенсивному загрязнению водах бухты ДЖО в сообществе копепод была несколько выше, чем в открытом прибрежье (разница статистически недостоверна), что может быть связано как с высокой скоростью разложения погибших организмов, так и с устойчивостью массовых видов копепод к загрязнению. Высокая статистически достоверная корреляция между оценками ДЖО, полученными с помощью НК и ДФ, подтверждает возможность успешного применения ДФ в полевых исследованиях морского зоопланктона в качестве витального маркера.Материал ДИССИПАЦИЯ ЭНЕРГИИ, ПРОДУКТИВНОСТЬ И СКОРОСТЬ ОБОРОТА БИОМАССЫ В СООБЩЕСТВЕ БАКТЕРИОПЛАНКТОНА: СРАВНИТЕЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ДВУХ ВОДНЫХ ЭКОСИСТЕМ(Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2000) Муханов, В. С.; Рылькова, О. А.; Лопухина, О. А.; Кемп, Р. Б.В Севастопольской бухте Черного моря (СБ), и в прибрежье Аберистуита, залив Кардиган, проведены сравнительные исследования обилия и функциональной активности бактериопланктона. Продукцию энтропии и траты сообщества на энергетический обмен оценивали по его теплопродукционным характеристикам с помощью микрокалориметрии. Средние in situ продукционные показатели, скорость оборота и величина бактериальной биомассы были выше (в 2-6 раз) в акватории СБ, тогда как значения удельной диссипативной функции (ψ) в обеих экосистемах оказались сходными. На "грязных" станциях в СБ интенсивность теплопродукции и, соответственно, значение ψ-функции ниже.Материал Материал КИНЕТИКА РОСТА И ВЫЕДАНИЯ БАКТЕРИАЛЬНОГО НАСЕЛЕНИЯ ПЛАНКТОННЫХ АГРЕГАТОВ: ОЦЕНКА С ПОМОЩЬЮ МЕТОДА РАЗБАВЛЕНИЙ(Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2001) Муханов, В. С.; Кирин, М. П.; Поликарпов, И. Г.С помощью метода разбавлений исследовали удельную продукцию и скорость выедания бактериальных клеток в планктонных агрегатах и в окружающей воде. Установлено, что удельная продукция бактерий в агрегатах была в 2-4 раза выше, чем в окружающей воде (1,63 - 7,75 против 0,38 - 3,94 сут.-1), средняя скорость выедания и её вариабельность были выше у агрегированных клеток (1,70 ± 1,45 (SD) сут.-1 в агрегатах против 1,15 ± 0,62 сут.-1 в воде). Даже при низкой численности эпибактерий в морской воде (23.9 ± 34.7 (SD) x 103 кл. мл-1) агрегированное распределение клеток вело к значительным ошибкам (до 17 %) в оценках скоростей роста и выедания бактериопланктона.Материал Концепция энергетического баланса в приложении к микробной пищевой сети водных экосистем(2013) Муханов, В. С.Современная система взглядов и представлений об организации и механизмах регулирования потоков энергии в водных экосистемах требует ревизии, поскольку в её основу положен ряд ошибочных постулатов: 1) поток энергии через экосистему – следствие лишь трофодинамики и не включает иных процессов; 2) дыхание – единственный катаболический процесс в столбе воды, вкладом анаэробных процессов в интегральный метаболизм микроорганизмов можно пренебречь; 3) источники теплопродукции в пробе воды связаны исключительно с внутриклеточным метаболизмом. Отсутствие заметного прогресса в развитии концепции энергетического баланса водных экосистем обусловлено, прежде всего, несовершенством методов прямого измерения диссипации тепловой энергии биологическими системами. Острый дефицит данных о физиологической активности микропланктонных организмов восполняется косвенными оценками скорости их метаболизма на основе измерений материальных потоков (в первую очередь, продукции). В физиологических исследованиях преобладает экстенсивный подход, при котором предпочтение отдаётся измерению суммарного дыхания сообщества в единице объёма биотопа, а удельные скорости метаболизма, как правило, игнорируются. Корректность применения респирометрии для измерения потоков энергии в водных экосистемах подвергается сомнению и, следовательно, восполнение дефицита биоэнергетических данных требует кардинальной смены методологии исследований. В качестве одного из решений проблемы предлагается использование нанокалориметрии – высокочувствительного метода прямого измерения скорости теплового потока, который не требует концентрирования проб микропланктона.Материал Культивирование и регенерация трихоплакса Trichoplax sp. H2 из фрагментов тела и агрегатов диссоциированных клеток: перспективы генетической модификации(2022) Кузнецов, А. В.; Вайнер, В. И.; Волкова, Ю. М.; Цыганкова, В. М.; Бочко, Д. Н.; Муханов, В. С.Выполнены исследования на культивируемом в лаборатории простейшем многоклеточном животном Trichoplax sp. H2 с целью дальнейшей генетической модификации этого организма. Предлагается вводить генетическую информацию в суспензию клеток после диссоциации тела трихоплакса на отдельные клетки с последующей их агрегацией и регенерацией полученных агломератов в жизнеспособное животное. С этой целью мы исследовали динамику роста трихоплаксов в чашках Петри на матах из одноклеточной водоросли Tetraselmis marina. Особи были однородны на стадии экспоненциального роста. В экспериментах по посттравматической регенерации разрезали подопытных животных радиально и исследовали восстановление полученных частей под микроскопом. Оценивали интенсивность роста и размножения трихоплаксов на водорослевых матах — показатели, ухудшавшиеся по мере измельчения животных. Обнаружено, что утраченная часть тела трихоплакса замещается за счёт ремоделинга оставшихся клеток. После витальной окраски животных подвергали диссоциации на отдельные клетки в среде, лишённой двухвалентных катионов. Идентифицированы клетки грушевидной или округлой формы и клетки эпителия со жгутиками, которые сохраняли двигательную активность более 12 ч. Для количественной оценки популяции клеток с помощью проточной цитометрии пластинки трихоплаксов дезинтегрировали при добавлении 10 мкМ амлодипина. Показано, что трихоплакс размером 0,5–1,0 мм состоит примерно из 10 000 клеток. Обработка животных 10%-ным бычьим сывороточным альбумином (БСА) в течение различных промежутков времени свидетельствует в пользу существования тотипотентных клеток на периферии трихоплакса, вероятно в пояске пластинки. В экспериментах по репаративной регенерации удалось добиться диссоциации трихоплаксов на отдельные клетки при обработке 0,1%-ным БСА, а затем воссоздать живые организмы путём центрифугирования суспензии клеток и последующего диспергирования крупного осадка на фрагменты до 0,1 мм перед высевом многоклеточных агрегатов на питательные маты. Развитие этих агрегатов сопровождалось активными движениями клеток и эпителизацией поверхности, что приводило к увеличению клеточной массы, формированию пластинки, росту и дальнейшему вегетативному делению трихоплаксов. Предполагается, что пребывание экспериментальных животных на искусственной стадии одиночной клетки в ряду бесполых размножений позволит интродуцировать в трихоплакса чужеродную генетическую информацию, например с целью изучения сигнальных систем, организации и функционирования этого многоклеточного организма. Трансгенез, основанный на диссоциации тела животного на отдельные клетки, возможно, будет применим и к другим организмам, обладающим высоким регенеративным потенциалом.Материал Метод прижизненной морфометрии ядерных эритроцитов рыб(2012) Андреева, А. Ю.; Муханов, В. С.Разработан метод прижизненной морфометрии эритроцитов рыб с использованием витальных красителей. Для окраски ядер клеток применен флюорохром SYBR Green I. Сделаны фотографии эритроцитов в толстой капле, снимки проанализированы в компьютерной программе ImageJ 1.44р. Полученные значения длин большой и малой оси ядра и клетки усреднены и сопоставлены с результатами измерений на мазках крови, окрашенных по Паппенгейму. Различия не превышали 2%.Материал Потребление частиц микропластика гетеротрофной динофлагеллятой Oxyrrhis marina(2023) Рауэн, Т. В.; Муханов, В. С.; Аганесова, Л. О.Включение частиц микропластика (МП) в микробную пищевую цепь и их дальнейшая передача на более высокие трофические уровни практически не исследованы. В данной работе закономерности поглощения МП одноклеточными организмами анализировали в культуре гетеротрофной динофлагелляты Oxyrrhis marina (OXY). В качестве пищевых объектов для O. marina использовали гаптофитовую микроводоросль Isochrysis galbana (ISO), полистирольные микросферы (MS) размером 5,6 мкм, а также их смесь (ISO-MS). Динамику численности микроорганизмов и микросфер изучали с помощью проточного цитометра. Показано, что гетеротроф O. marina потреблял частицы МП даже в условиях наличия своих обычных жертв — микроводорослей; при этом МП не оказывал на него негативного влияния. Скорости выедания «жертв» в смеси OXY-ISO-MS составили (0,21 ± 0,01) MS·кл−1·ч−1 (± стандартное отклонение) и (0,38 ± 0,01) ISO·кл−1·ч−1 и были достоверно ниже, чем в экспериментах с монодиетами OXY-ISO [(1,93 ± 0,68) ISO·кл−1·ч−1] и OXY-MS [(0,45 ± 0,04) MS·кл−1·ч−1], то есть усложнение состава (расширение спектра) пищевых объектов вело к снижению скорости их потребления. Скорость осветления среды динофлагеллятой O. marina в экспериментах с монодиетами составила (0,12 ± 0,04) и (0,19 ± 0,06) мкл·кл−1·ч−1 для OXY-ISO и OXY-MS соответственно, а значит, на поимку клеток ISO динофлагеллята O. marina затрачивала меньше времени, чем на поимку MS. Эту же закономерность наблюдали и в экспериментах со смесью пищевых объектов (OXY-ISO-MS): скорость осветления среды в сосудах с ISO [(0,17 ± 0,02) мкл·кл−1·ч−1] была незначительно ниже, чем в сосудах с MS [(0,19 ± 0,003) мкл·кл−1·ч−1]. Трофической адаптации O. marina к MS не происходило, на что указывал факт их вторичного потребления даже в условиях наличия альтернативного кормового объекта — I. galbana. Не была выявлена и селективность питания O. marina ни к одной из «жертв», будь то I. galbana или пластиковые микросферы. Полученные результаты указывают на возможность (и высокую вероятность) включения МП в микробную пищевую цепь и на важную роль одноклеточных организмов в передаче МП на более высокие трофические уровни.Материал Правила Клейбера и Рубнера в приложении к метаболической активности микропланктона(Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2005) Муханов, В. С.Материал Продукционные показатели коловраток Brachionus plicatilis при питании микроводорослями разных таксономических групп(2012) Рауэн, Т. В.; Муханов, В. С.; Ханайченко, А. Н.Экспериментально определены продукционные показатели коловраток Brachionus plicatilis (прирост численности, скорость фильтрации, рацион, удельная скорость и валовая эффективность роста К1) в накопительной культуре при питании микроводорослями Dunaliella salina, Isochrysis galbana и Phaeodactylum tricornutum. Максимальные численности коловраток (320 экз. мл-1), удельная скорость их роста (1.4 сут-1) и К1 (27.6%) получены при питании микроводорослями P. tricornutum, при этом скорость фильтрации микроводорослей была минимальной (1.4 мкл экз.-1 ч-1),. Питание микроводорослями I. galbana требовало высоких скоростей фильтрации среды (2.3 мкл экз.-1 ч-1) и величин рациона (0.17 мкг сыр. в. экз.-1 ч-1), но обеспечивало низкую эффективность роста (К1 = 11.3%). Таким образом, P. tricornutum является оптимальным для питания B. plicatilis. Бактерии, вносимые в экспериментальную среду с неаксеничными культурами микроводорослей, активно выедались коловратками. Бактериальный рацион коловраток, измеренный в эксперименте (1.5 – 4 нг сыр. в. экз.-1 ч-1), может быть значительно недооценён при условии, что бактериальная продукция в экспериментальных сосудах существенно превышала таковую в контроле.Материал СЕЛЕКТИВНОСТЬ ПИТАНИЯ КОПЕПОД РАЗНЫХ ЭКОЛОГИЧЕСКИХ ГРУПП МИКРОВОДОРОСЛЯМИ(Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2016) Ханайченко, А. Н.; Аганесова, Л. О.; Муханов, В. С.; Сахонь, Е. Г.; Рауэн, Т. В.Экспериментальные исследования питания копепод Calanipeda aquaedulcis, Arctodiaptomus salinus, Acartia tonsa и Oithona davisae смесью из 5 видов микроводорослей сем. Dinophyceae, Prymnesiophyceae, Prasinophyceae, Cryptophyceae (ESD 4.7–9.5 мкм) выявили значимые видоспецифичные различия их селективности. Отличительной особенностью O. davisae являлась достоверная положительная избирательность по отношению к криптофитовым и отрицательная - по отношению к остальным микроводорослям.Материал СТРУКТУРА СООБЩЕСТВА ПИКОФИТОПЛАНКТОНА В РАЙОНЕ АВАРИЙНОЙ УТЕЧКИ СТОЧНЫХ ВОД ЮЖНЕЕ М. ХЕРСОНЕС (ЧЕРНОЕ МОРЕ)(Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2016) Рылькова, О. А.; Муханов, В. С.; Сахонь, Е. Г.; Смирнова, Л. В.; Кондратьев, С. И.Сообщество пикофитопланктона исследовали методами проточной цитометрии в районе предполагаемой утечки сточных вод южнее м. Херсонес (юго-западный Крым, Чёрное море) в сентябре 2015 г. Факторный анализ комплекса микробиологических и гидрохимических переменных показал, что структурные и функциональные показатели пикофитопланктона не были связаны с локальным повреждающим эффектом сточных вод на морскую экосистему.Материал Усовершенствованный метод определения доли живых организмов в морском зоопланктоне после окраски нейтральным красным и диацетатом флуоресцеина(2012) Литвинюк, Д. А.; Муханов, В. С.Степень окрашенности организмов зоопланктона витальными красителями может сильно варьировать, и, как следствие этого, слабо окрашенные особи трудно классифицировать как однозначно живые или мёртвые. Вывод исследователя о принадлежности организма со «спорной» окраской к той или иной категории может носить субъективный характер. В работе рассмотрен усовершенствованный способ идентификации живых/мёртвых организмов в окрашенных пробах мезозоопланктона путём оцифровки их изображений, осреднения цветовых (тоновых) и яркостных характеристик каждой из анализируемых особей и последующего дискриминантного анализа полученных данных для объективного и достоверного разделения всей исследуемой популяции на живых и мёртвых особей.