ЭЛЕКТРОННАЯ КОЛЛЕКЦИЯ ПАРАЗИТОВ РЫБ МИРОВОГО ОКЕАНА ИНСТИТУТА МОРСКИХ  БИОЛОГИЧЕСКИХ  ИССЛЕДОВАНИЙ  ИМ. А. О. КОВАЛЕВСКОГО

Биологические коллекции –– основа для таксономических исследований и изучения биологического разнообразия регионов. Задача настоящей работы –– создание электронного каталога коллекционных образцов и таксономической базы данных (БД), а также развитие веб-ресурса для доступа к ним с целью интегрирования биологических коллекций в исследовательский процесс. Коллекция паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН послужила материалом для создания сайта, который написан на PHP с использованием сценариев JavaScript и работает под управлением веб-сервера Apache. Управление БД осуществлено при помощи СУБД MySQL. Сайт marineparasites.org включает каталог коллекционных материалов, таксономическую базу данных и библиотеку публикаций о видах паразитов рыб. Интерфейс сайта обеспечивает доступ к перечисленным ресурсам. В основе функционирования сайта лежат четыре связанные друг с другом сущности: объект хранения, организмы, таксоны и публикации. Каждому понятию соответствует таблица базы данных. В процессе ввода система автоматически формирует связи между коллекционными экземплярами организмов, их типовым статусом и прочими атрибутами. Посетители сайта при помощи выборок и фильтров делают запросы и получают целостное представление о коллекции. Страница таксона состоит из данных о систематическом положении вида и его синонимах. На странице о виде-паразите расположен индикатор наличия экземпляров вида в коллекции, перечень атрибутов коллекционных экземпляров, публикации, где упоминается данный вид, типовой район и хозяин вида-паразита, а также другие места и хозяева находок, описания и изображения видов. Таким образом, пользователь планомерно переходит от описаний видов паразитов к их хозяевам, от коллекционных образцов –– к изображениям и диагнозам видов, к публикациям и обратно. Сайт сделан англоязычным, что даёт возможность зарубежным и отечественным исследователям получить информацию о коллекции паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН и интегрировать её в международные веб-ресурсы по биоразнообразию. Аудитория сайта –– профессиональные исследователи паразитов, но заложенные идеи позволяют достроить сайт до виртуальной коллекции любых организмов или до веб-портала о разнообразии флоры и фауны любого региона. Сайт является результатом плодотворного взаимодействия биологов и программистов, способствует интенсификации обмена коллекционными данными и образцами и служит инструментом исследования паразитарной компоненты морских сообществ.

Аннотация (alternative)

Biological collections are the basis for taxonomic research and study of the regional biodiversity. The aims of this work are the creation of an electronic catalogue of collection specimens and taxonomic database (DB), as well as the development of a web resource to access them, for integrating biological collections in the research process. The IMBR Collection of Marine Parasites is used as material for this site. The PHP and JavaScript programming languages are used for its creation and the relation database management system MYSQL is used for manage database. The website and database are operated by the Apache webserver. Website marineparasites.org includes the electronic catalog of the collection, the taxonomic database and the repository of publications about species of fish parasites. The website provides an interactive interface to access the above listed resources. The functioning of the website is based on four entities related to each other: a collection object, specimens, taxa, and publication. Each entity corresponds to a database table. During filling the tables, the system automatically creates connections between collection samples, their type and taxonomic status and other attributes. Visitors of the site can make requests using filters and get a complete representation on the collection. Webpage of taxon consists of the data on the species systematic position and its synonyms. Indicator of the presence of samples of the species in the collection, a list of attributes of collection exemplars, publications that mention this species, type locality and host of the parasite as well as other regions and hosts of its finding, description and images are located on the page of the parasite species. Thus, the user follows from the descriptions of the parasite species to their hosts, from the collection samples to their images and taxonomic diagnosis, publications on this parasite and inversely. English language of interface facilitates that more researchers can obtain information on the collection of marine parasites maintained by Institute of Marine Biological Research RAS and helps to integrate it into the international web resources on biodiversity. The site reports specific information to professional researchers of parasites, but ideas it is based on allow to develop it into a resource on collections of any organisms and diversity of flora and fauna of any regions. The site is the result of fruitful cooperation between biologists and programmers; it promotes the intensification of exchange of collection data and samples, and is a tool for studying parasite components of marine communities. Project is supported by Russian Foundation for Basic Research, Grant No 15-29-02684 ofi-m.

Ключевые слова

паразиты рыб, коллекция, электронный каталог, таксономическая база данных, биоразнообразие, Мировой океан

Библиографическое описание

Морской биологический журнал. - 2016. - Т. 1, № 3 https://repository.marine-research.ru/handle/299011/2617

URI

https://repository.marine-research.ru/handle/299011/2617

Коллекции

Морской биологический журнал. - 2016. - Т. 1, № 3.
History of SBS – IBSS establishment and development / История создания и развития СБС – ИнБЮМ
Информация о коллекциях ИнБЮМ

Полная информация о материале