Информация о коллекциях ИнБЮМ

Постоянная ссылка на коллекцию

Поиск

Новые материалы

Сейчас показывается 1 - 8 из 8
  • Материал
    Рабочая коллекция живых культур каротиногенных микроводорослей Института биологии южных морей имени А. О. Ковалевского
    (2021) Данцюк, Н. В.; Челебиева, Э. С.; Минюк, Г. С.
    В статье приведены сведения о специализированной рабочей коллекции каротиногенных микроводорослей отдела физиологии животных и биохимии Федерального исследовательского центра «Институт биологии южных морей имени А. О. Ковалевского РАН» (ФИЦ ИнБЮМ), созданной в рамках научной и прикладной тематик института для исследования механизмов стресс-толерантности у эврибионтных и экстремофильных одноклеточных фототрофов, а также для выявления коммерчески значимых источников высокоценных в медицинском и пищевом отношении кетокаротиноидов группы астаксантина. Коллекция насчитывает 44 штамма микроводорослей различной таксономической и экологической специализации с выраженной способностью к гиперсинтезу вторичных каротиноидов и липидов при экстремальных внешних воздействиях (высыхание, острое голодание, высокая освещённость, температура и солёность, действие токсикантов и др.). Основными способами пополнения фонда являются направленный обмен каротиногенными видами с ведущими российскими и зарубежными коллекциями микроводорослей и собственные полевые сборы в причерноморских зонах Крыма и Кавказа. Большинство штаммов в коллекции — представители двух порядков класса Chlorophyceae [Chlamydomonadales (25 штаммов) и Sphaeropleales (15 штаммов)], так как именно в этих порядках явление вторичного каротиногенеза распространено наиболее широко. Среди них преобладают обитатели эфемерных пресноводных водоёмов, аэрофильные и почвенные микроводоросли. Все штаммы поддерживаются в состоянии альгологически чистых культур при контролируемых условиях на агаризованных минеральных средах. Описания вариететов коллекции включают следующие сведения: а) современный таксономический статус вида, верифицированный с учётом обновлённых данных депонирующих коллекций и альгологических баз AlgaeBase и NCBI Taxonomy Browser; б) базионим и известные синонимы вида; в) время и источник поступления штамма в коллекцию; г) фамилию автора, географическое место и биотоп, из которого штамм был изолирован; д) номер штамма в NCBI (если есть); е) питательную среду, на которой штамм поддерживается в коллекции ФИЦ ИнБЮМ. Проанализировано значение коллекции для проведения морфобиологических и физиолого-биохимических исследований особенностей роста, вторичного каротиногенеза и биотехнологического потенциала зелёных микроводорослей.
  • Материал
    Коллекция морских планктонных водорослей Института биологии южных морей НАН Украины
    (Севастополь: ИнБЮМ, 2003) Стельмах, Л. В.; Галатонова, О. А.
    Дано описание единственной в Украине коллекции морских планктонных водорослей, основу которой составляют массовые виды, выделенные из планктона Черного моря и относящиеся к трем классам: Bacillariophyceae, Dynophyceae и Chlorophyceae. Для специалистов в области экологии, гидробиологии, физиологии и биохимии, использующих морские микроводоросли в качестве объекта исследований.
  • Материал
    Хранилище ангидробиозных культур микроводорослей и цианобактерий Института биологии южных морей имени А. О. Ковалевского РАН
    (2020) Харчук, И. А.
    Надёжное сохранение культур микроводорослей и создание генетических банков штаммов — одна из важных задач современной биологии. В каталоге Всемирной федерации культур в базе WDCM CCINFO на сегодняшний день зарегистрировано 792 коллекции различных культивируемых организмов из 76 стран. Это самая обширная сводная база данных, включающая как известные крупные коллекции, так и небольшие хранилища исследовательских и образовательных учреждений со всего мира. В базе представлено 47 альгологических коллекций и 80 коллекций микроорганизмов, которые также включают культуры микроводорослей и цианобактерий. В России зарегистрировано всего 30 биологических коллекций; фонды только 13 из них включают штаммы водорослей. Самый распространённый способ хранения культур микроводорослей — метод их периодических пересевов на жидкие среды или агар. Его используют в 127 коллекциях (99 % от общего количества в каталоге). Также применяют криоконсервацию — в 33 коллекциях (27 %), лиофилизацию — в 13 (11 %), L-высушивание — в 5 (4 %), замораживание — в 19 (16 %), иммобилизацию в альгинатных бусинках — в 1 (0,8 %). Между тем при использовании этих методов изменяются морфологические и функциональные свойства клеток сохраняемых культур и происходит их измельчание. Кроме того, поддержание культур в жизнеспособном состоянии трудоёмко и требует дорогостоящего оборудования. При этом хранение микроводорослей, переведённых в состояние ангидробиоза путём их обезвоживания, просто и экономически выгодно. Ангидробиоз — глубокое и длительное торможение метаболизма, обратимое при благоприятных условиях; это достаточно распространённое явление в природе. Единственная коллекция из базы WDCM CCINFO, для которой применяют способ перевода клеток в покоящееся состояние путём ангидробиоза (для почвенных водорослей) — коллекция культур водорослей Киевского национального университета (ACKU WDCM 994). Многолетние опыты по переводу микроводорослей в состояние ангидробиоза позволили разработать метод их длительного хранения без использования питательных сред, включающий перевод клеток в состояние ангидробиоза, их сохранение в дегидратированном состоянии и последующее выведение в активную культуру. С целью поддержания альгологического биоразнообразия на базе ФИЦ ИнБЮМ создано хранилище микроводорослей, переведённых в состояние ангидробиоза; их при необходимости можно вывести в активные культуры. Объектами стали морские одноклеточные водоросли, а также пресноводные и галобные виды низших фототрофов, перспективные для аквакультуры и биотехнологии. Культуры получены в виде инокулята из коллекции живых культур планктонных микроводорослей ФИЦ ИнБЮМ. Водоросли выращивали в накопительном режиме при постоянном освещении. Биомассу собирали во время культивирования альгологически чистых культур микроводорослей на стадии замедления роста или на стационарной стадии. Клетки отделяли от культуральной среды центрифугированием или путём их фильтрации на планктонном сите. Затем водоросли обезвоживали и хранили в герметичных зиплок-пакетах, помещённых в пластиковые ёмкости объёмом от 100 до 500 мл, при температуре +18...+21 °C в темноте в специально оборудованном помещении. Основная часть коллекции представлена штаммами из отделов Chlorophyta, Cyanophyta, Bacillariophyta, Rodophyta. В статье приведены список видов и количество сохраняемых изолятов, представлена информация о формах хранения, описан технологический регламент обслуживания и пополнения хранилища ангидробиозных культур. Хранилище находится на стадии формирования. Его будущее связано с расширением фонда за счёт морских, пресноводных и галобных видов. Оптимизация способа обезвоживания позволит перевести в состояние ангидробиоза микроводоросли, относящиеся к разным систематическим отделам.
  • Материал
    КОЛЛЕКЦИЯ ГИДРОБИОНТОВ МИРОВОГО ОКЕАНА ИМБИ ИМ. А.О. КОВАЛЕВСКОГО
    (Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2016) Царин, С. А.; Царина, Т. В.
    В Институте морских биологических исследований им. А. О. Ковалевского РАН собран уникальный коллекционный материал по морским гидробионтам, который не уступает по своей ценности лучшим мировым аналогам. Материал собран с начала ХХ века и охватывает практически весь Мировой океан. Коллекционные фонды помогают выполнять многие научные исследования. Необходимо сохранить коллекционный материал для следующих поколений учёных.
  • Материал
    КОЛЛЕКЦИЯ КУЛЬТУР ДИАТОМОВЫХ ВОДОРОСЛЕЙ КАРАДАГСКОЙ НАУЧНОЙ СТАНЦИИ (КРЫМ)
    (Marine Biological Journal, 2017) Давидович, Н. А.; Давидович, О. И.; Подунай, Ю. А.
    Несмотря на исключительную важность диатомовых в природных экосистемах, их генетический и биопродукционный потенциал почти не используется вследствие слабой изученности биологии и чрезвычайно низкой представленности в коллекциях культур. Отсутствует необходимый опыт выделения клонов (штаммов) диатомовых, постановки и содержания в культурах, недостаточно полны представления о жизненных циклах диатомовых. На Карадагской научной станции (Крым) занимаются изучением диатомовых водорослей более 40 лет. К настоящему времени сформирована рабочая коллекция, которая включает более 400 клонов, относящихся к 27 морским и 7 пресноводным видам. Регулярно пересеваемые культуры содержатся на жидких средах. Помимо Чёрного моря, морские виды отобраны в различных регионах всех океанов, а пресноводные – в отдельных регионах Евразии. Результаты исследования коллекции культур необходимы как для решения ряда научных проблем (выявления репродуктивных особенностей, биогеографии видов, внутривидовой изменчивости), так и для потенциального практического использования диатомовых водорослей в биотехнологиях.
  • Материал
    ЭЛЕКТРОННАЯ КОЛЛЕКЦИЯ ПАРАЗИТОВ РЫБ МИРОВОГО ОКЕАНА ИНСТИТУТА МОРСКИХ БИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ ИМ. А. О. КОВАЛЕВСКОГО
    (Marine Biological Journal, 2016) Дмитриева, Е. В.; Лях, А. М.; Корнийчук, Ю. М.; Полякова, Т. А.; Попюк, М. П.
    Биологические коллекции –– основа для таксономических исследований и изучения биологического разнообразия регионов. Задача настоящей работы –– создание электронного каталога коллекционных образцов и таксономической базы данных (БД), а также развитие веб-ресурса для доступа к ним с целью интегрирования биологических коллекций в исследовательский процесс. Коллекция паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН послужила материалом для создания сайта, который написан на PHP с использованием сценариев JavaScript и работает под управлением веб-сервера Apache. Управление БД осуществлено при помощи СУБД MySQL. Сайт marineparasites.org включает каталог коллекционных материалов, таксономическую базу данных и библиотеку публикаций о видах паразитов рыб. Интерфейс сайта обеспечивает доступ к перечисленным ресурсам. В основе функционирования сайта лежат четыре связанные друг с другом сущности: объект хранения, организмы, таксоны и публикации. Каждому понятию соответствует таблица базы данных. В процессе ввода система автоматически формирует связи между коллекционными экземплярами организмов, их типовым статусом и прочими атрибутами. Посетители сайта при помощи выборок и фильтров делают запросы и получают целостное представление о коллекции. Страница таксона состоит из данных о систематическом положении вида и его синонимах. На странице о виде-паразите расположен индикатор наличия экземпляров вида в коллекции, перечень атрибутов коллекционных экземпляров, публикации, где упоминается данный вид, типовой район и хозяин вида-паразита, а также другие места и хозяева находок, описания и изображения видов. Таким образом, пользователь планомерно переходит от описаний видов паразитов к их хозяевам, от коллекционных образцов –– к изображениям и диагнозам видов, к публикациям и обратно. Сайт сделан англоязычным, что даёт возможность зарубежным и отечественным исследователям получить информацию о коллекции паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН и интегрировать её в международные веб-ресурсы по биоразнообразию. Аудитория сайта –– профессиональные исследователи паразитов, но заложенные идеи позволяют достроить сайт до виртуальной коллекции любых организмов или до веб-портала о разнообразии флоры и фауны любого региона. Сайт является результатом плодотворного взаимодействия биологов и программистов, способствует интенсификации обмена коллекционными данными и образцами и служит инструментом исследования паразитарной компоненты морских сообществ.
  • Материал
    История гербария водорослей Карадага: известные и неизвестные страницы
    (2009) Мильчакова, Н. А.; Рябогина, В. Г.; Бондарева, Л. В.; Миронова, Н. В.
    Приведены исторические сведения о гербарии макроводорослей Карадага, который включает образцы, собранные в период с 1916 по 1970 гг. выдающимися отечественными альгологами Л.И. Курсановым, Н.А. Комарницким, Н.В. Морозовой-Водяницкой, А. А. Калугиной-Гутник, сотрудниками Карадагской биологической станции, другими специалистами, студентами. Общее количество гербарных образцов составляет 3079, сегодня они хранятся в гербарии макрофитов Мирового океана Института биологии южных морей НАН Украины, являющимся национальным достоянием Украины. Выполнен хорологический анализ гербарных сборов, приведены исторические сведения о коллекторах. Показана роль Карадагской биологической станции в становлении альгологических исследований на Черном море.